甲狀腺過氧化物酶抗體濃度可以升高，但是正常值在不同實驗室使用不同試劑盒單位不同，結果是不同的，一般＜30IU/ml。

抗甲狀腺過氧化物酶抗體存在於甲狀腺細胞內微粒體當中，稱為抗甲狀腺過氧化物酶抗體，是微粒體的主要組成部分。甲狀腺過氧化物酶是潛在自身抗原，從細胞內向細胞外洩漏時，刺激機體產生抗甲狀腺過氧化物酶抗體。

抗甲狀腺過氧化物酶抗體測定有助於自身免疫性疾病診斷。90%以上慢性淋巴細胞性甲狀腺炎患者具有高濃度抗甲狀腺過氧化物酶抗體，70%的Graves病患者甲狀腺過氧化物酶抗體濃度升高。

抗甲狀腺過氧化物酶抗體陽性的同時，要測定促甲狀腺功能，即T3、T4、TSH水平，綜合判斷是否存在慢性淋巴細胞性甲狀腺炎或Graves病。