腸胃腫瘤也有良性的病變。作為胃腸腫瘤，根據病變性質不同，分為良性及惡性病變。良性病變在臨床上相對較多，包括起源於胃腸黏膜的息肉、腺瘤，在體檢時經常能夠發現，通過鏡下可以將息肉或小型腺瘤切除掉，完善病理檢查。除此以外，還有源於肌層的腫瘤，如平滑肌瘤，還有其他的血管瘤纖維瘤等，也屬於良性疾病。

除了良性病變以外，還有惡性的疾病。出現惡性腫瘤一方面可能會有消化系統，如排便習慣及排便性狀的改變，或胃腸道的不適症狀。結合胃腸鏡的檢查，能夠發現突出於腸腔的異常隆起、凹陷，潰瘍性、菜花樣的病變或者狹窄樣的病變，或者瀰漫、浸潤性的病變。通過形態學的發現，及早完善病理診斷，明確為惡性腫瘤，要在定性和定量完全明確的情況下，及早給予後續的抗腫瘤治療，從而進一步地改善病人的預後。