胃平滑肌瘤要根據平滑肌瘤大小、位置及浸潤深度選擇不同治療方式。如果平滑肌瘤比較小、位置比較表淺、位置比較特殊，首先選擇經內鏡下治療。隨著醫療技術水平提高，內鏡下可完整將腫瘤切除。

如果平滑肌瘤比較大，同時浸潤深度較深，內鏡下無法切除，首選方式是要進行手術治療。21世紀隨著醫療技術水平提高，現在首先推薦是微創治療，即肚子可通過打幾個洞，完整把腫瘤切除，術後恢復快，能起到良好效果，對平滑肌瘤整體治療效果非常好。