新生兒肺炎的治療是一種綜合治療，其治療療程一般需要1-2周左右，嚴重的可能需要更長的時間。治療方法包括以下幾點：

1、抗病原體治療：細菌性肺炎應早期使用抗生素，如肺炎的致病菌不確定，醫生可先憑經驗選用抗生素進行治療，待結果回報後再選用敏感的抗生素，如為支原體、衣原體感染，可以選用紅黴素、阿奇黴素等進行治療；如為病毒感染，可以根據病原選用干擾素、更昔洛韋、阿昔洛韋等抗病毒治療；

2、對症治療：可給予霧化、吸痰、吸氧等對症治療。對於呼吸困難嚴重的患兒，可以給予呼吸機支持治療，同時應給予支持療法，保證充足的能量和營養供給，糾正循環、水、電解質以及酸鹼平衡紊亂。