腮腺炎可能會導致男性不育，但較為少見。腮腺炎病毒可以侵入其他器官和系統，只有腮腺炎病毒侵入生殖系統，影響到睪丸時，才有可能會導致不育症發生，因為腮腺炎病毒可能會導致輸精管道堵塞，產生炎症，多表現為單側或雙側睪丸紅腫、疼痛。少數的嚴重情況，可能會導致睪丸萎縮，使睪丸發生不可逆的病理性變化，造成少精子症甚至無精子症，從而影響生育。
腮腺炎病毒還可能侵入神經系統，引起腦炎、腦膜腦炎，侵入生殖系統也可以導致女性出現卵巢炎，不過比較少見。若患有腮腺炎，應及時就醫，早期可應用抗病毒藥物，如利巴韋林進行治療。如果發熱、脹痛，可以託高陰囊，進行局部冷敷，或在醫生指導下服用鎮痛藥如布洛芬緩釋膠囊。若腮腺炎很嚴重且合併其他併發症，如睪丸炎、腦膜炎、心肌炎，也可小劑量使用激素如地塞米松等進行治療。