新生兒重度黃疸在出生後12-48小時出現症狀，臨床上分為四期：

1、警告期：會出現嗜睡、反應低下、吸吮無力、擁抱反射差、肌張力低，偶有尖叫、嘔吐，一般在12-24小時後進入痙攣期；

2、痙攣期：出現抽搐、角弓反張、發熱，輕者凝視，重者肌張力高、呼吸暫停，此期持續12-48個小時；

3、恢復期：吃奶後好轉，抽搐減少、角弓反張消失、肌張力恢復正常，持續時間為2周；

4、後遺症期：出現手足徐動、眼球運動障礙、聽覺障礙、牙釉質發育不良的四聯徵，或者出現腦癱後遺症。此外還伴有輕微的神經功能障礙，表現為認知、學習、運動障礙，或僅表現為耳聾或者聽覺障礙。

新生兒高膽紅素血癥最嚴重的併發症是膽紅素腦病，早產兒易出現，多在生後4-7天起病。非結合膽紅素透過血腦屏障導致神經系統障礙，基底神經節、海馬體、下丘腦神經核和小腦神經元出現壞死，神經核黃染，此時稱為核黃疸。