卵巢囊腫本身可以是良性，也可以是惡性。對於腫瘤標誌物是抽取血液，查血液中的特殊成分。常見的卵巢腫瘤標誌物有以下幾種：

1、CA12-5：在卵巢腫瘤中，上皮類卵巢腫瘤時CA12-5會增高；

2、AFP：又稱甲胎蛋白，在肝癌時升高比較明顯。但是如果是卵巢腫瘤甲胎蛋白(AFP)高，證明卵巢腫瘤中有甲胎蛋白的成分出現，即有胚胎成分出現，所以產生AFP；

3、HCG：即人絨毛膜促性腺激素，也是早孕期所查的指標。有個別卵巢腫瘤中有滋養細胞的成分，可以產生HCG增高；

4、雌激素：功能性卵巢腫瘤，比如顆粒細胞瘤、泡沫細胞瘤時雌激素水平可以增高。

因此對於卵巢的腫瘤標誌物是多方面，任何一個腫瘤標誌物的增高，再加上卵巢腫物的出現，均需要認真判定其性質。