新生兒敗血症的早期症狀不典型，表現為進拒乳、溢乳、煩躁不安、哭聲低、反應低、發熱或體溫不升、面色蒼白或灰暗、體重不增等非特異性症狀。部分患兒會先出現黃疸，黃疸可為敗血症的唯一表現，出現黃疸不退或退而復現；另外，還可出現肝脾大，出血傾向、中毒性腸麻痺、彌散性血管內凝血（DIC）、尿量減少、呼吸窘迫綜合徵、腦膜炎等表現。