胰十二指腸切除術是普外專業裡較大的手術，因為涉及的器官比較多，所以手術以後的併發症比較多，而且都是在1周到10天之內出現，大多數併發症為胰瘻、膽瘻、吻合口瘻、出血、腹腔感染。

因為這個手術涉及的器官比較多，需要切除胰頭、膽總管下段、十二指腸、胃竇的一部分，所以切除完以後需要做消化道重建比較多。消化道重建跟膽道重建有可能就會出現膽瘻，胰腺和空腸吻合手術以後有可能併發症胰瘻，和胃做的吻合手術以後可能出現的吻合口瘻，還有吻合口的出血。從瘻出來的東西以及出血在腹腔內可以形成細菌感染，導致腹腔感染，這些都是比較頭疼的問題。但是一般臨床都有相應的辦法處理，隨近幾年微創發展，相對併發症逐漸開始減少，而且病人恢復的也相對越來越好。