十二指腸潰瘍的治療首先從基礎治療開始，要注意生活飲食、起居狀態；要避免辛辣、刺激、不規律飲食；避免過於油膩的飲食，因為過於油膩的飲食對胃酸的分泌有刺激作用。如果起居不規律、熬夜、日程排得很滿，對於潰瘍的癒合也都是不利因素。

在藥物治療上，主要還是使用質子泵抑制劑，如雷貝拉唑、奧美拉唑這類藥物，抑制胃酸分泌，90%-100%的病人可基本達到癒合。十二指腸潰瘍患者吃藥以後，一般不需要再進行胃鏡複查，十二指腸潰瘍其實最主要的病因是幽門螺桿菌感染，所以在完成潰瘍的藥物治療療程以後，一定要檢查是否有幽門螺桿菌感染，如果有幽門螺桿菌感染，應進行根除。