陰莖里長肉刺考慮與珍珠樣陰莖丘疹、龜頭炎、尖銳溼疣等因素有關，建議患者積極就醫進行評估。日常要注意局部衛生護理，同時還要注意性生活衛生。

1、珍珠樣陰莖丘疹：在陰莖龜頭冠狀溝部位，也可能有細小圓錐狀、成排排列的小丘疹，類似肉刺，為白色或淡紅色，常與手淫、不注意局部衛生等因素有關，多沒有不適症狀，可隨誘因改善而自行消失，不用進行特殊處理；

2、龜頭炎：如果患者包皮較長，而且日常不注意衛生，可能導致汙物藏於包皮內，刺激龜頭，引發炎症感染，因為炎症刺激，可導致皮膚黏膜增生，形成肉芽，還可伴有龜頭紅腫、疼痛等表現。患者需要積極進行衛生清潔，並遵醫囑控制炎症，如使用甲硝唑片、紅黴素軟膏等，炎症消退後還應切除過長的包皮；

3、尖銳溼疣：患者有不潔性生活，或接觸人乳頭瘤病毒感染者使用的物品等，導致感染人乳頭瘤病毒，可能會引發尖銳溼疣，出現陰莖、陰囊、肛周疣狀贅生物，可逐漸增大，並變為白色、汙灰色等，可在醫生指導下使用鬼臼毒素酊控制症狀，也可通過激光、冷凍等方式消除疣體。

除上述可能外，還要考慮與陰莖繫帶旁腺增生、皮脂腺異位症、假性溼疣等因素有關。患者無法明確可能的原因，尤其是考慮有傳染性疾病時，建議到性病科就診、治療。