十二指腸潰瘍大多數會有一些臨床表現，如上腹痛，十二指腸球部潰瘍上腹痛的規律一般表現為空腹痛，進食後可略緩解，還有夜間痛。還可伴有其它的消化不良表現，如上腹脹、噁心、打嗝等。嚴重者可出現黑便，輕度、少量、短暫的黑便可沒有過多的臨床表現。如果持續的時間長，可出現失血性貧血的表現，如頭暈、乏力、面色蒼白。還在胃鏡下表現為十二指腸球部侷限性的黏膜凹陷，可附著白苔，大小不等。十二指腸潰瘍可以在患者的臨床表現以及胃鏡下的表現做出診斷。