膽紅素進入腦組織以後會導致腦損傷，但因早期肉眼無法判斷膽紅素是否進入腦組織，同時，即使目前可通過核磁檢測瞭解膽紅素進入腦組織情況，但一般不用於臨床。因此，當膽紅素達到較高水平後，要儘早清除膽紅素，降低膽紅素腦病發生的可能，或者膽紅素腦病的損傷程度。
但由於核磁檢查從準備到完成至少1個小時，所以為不影響清除血液中的膽紅素，不建議臨床上採取此檢查方式，即使檢查也是待膽紅素控制在安全水平以下在進行。
膽紅素腦損傷在發生的後期，會出現一系列的臨床症狀，比如嗜睡、尖叫、反應差、吃奶無力，甚至發熱等，往往表示膽紅素腦病已經發生，且進入腦組織，可能會留下後遺症。