孕晚期滴蟲性陰道炎由於局部炎症，可能會導致胎膜早破、早產、宮內感染、新生兒感染等。孕晚期通常指妊娠28周後，如果合併滴蟲性陰道炎需要積極給予治療，包括局部使用甲硝唑來進行治療。如果沒有及時進行治療，滴蟲性陰道炎一方面可以引起患者本身出現分泌物增多、發黃，以及外陰瘙癢等不適，從而影響正常的生活和工作。另一方面由於局部滴蟲的存在，還會造成局部炎症，而炎症可能會逆行感染導致胎膜局部脆性下降，繼而出現胎膜早破。

如果胎膜早破出現在37周前會導致早產，由於胎兒此時各個系統發育不成熟，不但存活率下降，而且即使存活，還可能合併呼吸窘迫綜合徵、缺血缺氧性腦病、黃疸、電解質異常等常見的早產兒併發症。另外，即使是到37周後再發生胎膜早破，由於局部存在炎症，可能逆行感染導致宮內感染，患者出現發熱，而胎兒可能感染出現肺炎，需要去兒科進行治療。