腸易激綜合徵一般通過大便常規檢查、大便隱血檢查進行篩查，也建議患者進行腸鏡檢查，明確是否存在腸道息肉、腸道腫瘤以及炎症性腸病。

對於便秘的患者，可能是由於盆底肌肉痙攣導致，因此需要進行盆底肌的肌張力測定。此外，患者可能還需要進行腹部B超或者CT檢查，排除腹腔內臟器疾病。因為腸易激綜合徵的發生與心理、精神因素非常密切，對於反覆發作的患者，還需要進行心理疾病的評估。

腸易激綜合徵患者有腹痛、腹脹、腹部不適表現，同時伴有排便異常，診斷的重點在於排除其它可以解釋這些症狀的病理和器質性疾病。所以對於存在上述表現，同時伴有報警症狀，比如年齡＞40歲以上的患者，出現大便結血、糞便隱血陽性、貧血表現，或者有腹部包塊、腹水、發燒、體重減輕或者家族內存在結腸癌病史，需要去專科門診進行一系列的檢查以明確病因。