巧克力囊腫屬於卵巢激素相關疾病，隨著卵巢每個月分泌激素，巧克力囊腫可能逐漸加重，如果不進行治療，可能出現以下情況：

1、痛經：巧克力囊腫較小時可能無明顯症狀，待巧克力囊腫逐漸加重，患者可能出現痛經，初始時疼痛較輕，後期疼痛逐漸加重，可能影響上班或學習，嚴重時需要服用止痛藥物進行治療；

2、慢性盆腔痛：部分患者即使不來月經時也會疼痛，稱慢性盆腔痛；

3、囊腫破裂：部分巧克力囊腫生長較大後，可能自行破裂而導致患者產生劇烈腹痛；

4、其它症狀：部分患者可能出現性交痛、懷孕困難或懷孕後易流產等情況。

上述均是巧克力囊腫可能產生的危害，如果患者發現巧克力囊腫，建議及時進行治療。