卵巢巧克力囊腫有時會發生破裂，在患者月經來潮時，巧克力囊腫裡面異位的子宮內膜也會出血，出血後巧克力囊腫的壓力增加，增加後表面可能出現破口，根據破口大小不同，症狀也有所不同，具體症狀分析如下：

1、破口較小：如果患者巧克力囊腫破裂的破口較小，巧克力囊腫也不大時，巧克力囊腫內流出的東西，較快被周圍組織粘連、包裹。此時患者可能有一過性腹痛，通常可能與痛經混淆，腹痛往往能較快緩解；

2、破口較大：如果患者的巧克力囊腫體積較大，可能發生破裂，破口一般比較大，巧克力囊腫內呈巧克力樣液體，通常會流入盆腹腔裡，此類液體會刺激腹膜，引起劇烈的疼痛，通常被稱為急腹症。通常患者無法耐受此類疼痛，也有部分患者同時伴有噁心、嘔吐或肛門墜脹的感覺。所以出現此類情況時，患者需要立刻到急診科掛急診號，儘快進行診治，通常需要急診手術。