腸道功能紊亂的症狀可以分為兩種，一種是腸道過度活躍，另一種是腸道蠕動減少。過度的活躍表現為腹痛、大便次數增多、腹部隱痛；

蠕動減少表現為腹脹或排氣、排便不暢。腸功能紊亂在不同的人群當中表現也不一樣，小孩的腸功能紊亂多是因為飲食不潔引起；

成人的腸功能紊亂可能提示一些疾病，比如腸易激綜合徵、潰瘍性結腸炎。另外，成年人也可能由精神壓力比較大，出現腸功能紊亂。對於腸道蠕動減少這種情況，糖尿病患者比較多見。

此外，部分隱匿性疾病比如腸道腫瘤也可以表現為腸功能紊亂，這時候需要進行胃鏡和腸鏡檢查，進一步明確其原因。