卵巢巧克力囊腫由子宮內膜異位症引起，是子宮內膜異位症的一種表現。巧克力囊腫對妊娠、對患者的體徵都會造成影響，根據具體情況可以選擇手術治療。如果囊腫＜4cm以下，患者沒有明顯的症狀，或者沒有生育要求、沒有引起不孕，可以觀察，暫時不需要手術；若巧克力囊腫＞4cm，或者影響懷孕，導致不孕，建議行手術治療。

手術可以選擇腹腔鏡手術處理或者囊腫剝除。如果在複查過程中發現巧克力囊腫突然增大，或者有惡變的傾向，也建議行手術治療。通過檢查血CA125進行大約的判斷，巧克力囊腫的演變還有預後發展情況。巧克力囊腫術後仍然有可以懷孕的可能，因此不必擔心。得了巧克力囊腫，應注意觀察，根據個人的情況及時到醫院就診，進行相應處理。