腸易激綜合徵腹痛、腹瀉可用鈣離子拮抗劑（匹維溴銨）等解痙藥。腹痛嚴重者，可用質子泵抑制劑止痛。腹瀉可用思密達、培菲康、整腸生、雙歧桿菌等調整腸道菌群的西藥。還可用抗抑鬱焦慮的藥。便秘可用乳果糖類滲透性瀉藥，也可用麻仁潤腸丸等中成藥。還可採用按摩、穴位貼敷、針灸等治療。