霧化在兒童哮喘的治療中有較為重要的作用，很多藥物都需要通過霧化的方式進入氣道，比如β2受體激動劑、糖皮質激素、抗膽鹼能藥物，還包括祛痰藥物。霧化的副作用取決於藥物的特性，但兒童霧化藥物的副作用相對較小。

通過國外、國內的基礎臨床研究表明，糖皮質激素即ICS，作用於局部後，其餘部分進入體內也很快被肝臟所滅活，所以對人體影響較小。糖皮質激素吸入後要注意局部口腔清潔。沙丁胺醇或特布他林等β2受體激動劑吸入後，可能會引起一過性心率增快，霧化後可好轉。同時，霧化時兒童一定要處於安靜、不哭鬧的狀態。

此外，部分兒童在霧化吸入抗膽鹼能藥物，比如異丙託溴銨時，可能會有臉紅、心率增快等症狀，通常為一過性表現，霧化後也很快隨著藥物的代謝而好轉，但多數兒童不會出現上述反應。