甲溝炎最佳的治療方法可以應用中醫以及西醫的治療方案。中醫方面可以應用五味消毒飲加減治療。主要的方劑組成是金銀花、連翹、紫花地丁、紫背天葵、蒲公英等煎水口服200ml，每日兩次。也可以應用中藥冷溼敷的方式，一天兩次，一次20分鐘。主要的組成成分是金銀花、連翹、黃柏、黃芩、馬齒莧。

在西醫方面需要進行抗炎、抗感染的治療，可以靜點青黴素鈉注射液，或者是頭孢西丁鈉注射液。如果病情不是很嚴重可以僅僅口服阿莫西林膠囊，或者是羅紅黴素膠囊即可。在外面的選擇上除了溼敷雷夫諾爾溶液之外，還可以塗抹莫匹羅星軟膏抗炎、抗感染治療。