新生兒呼吸衰竭的原因，最常見的包括三部分，第一個是氣道的問題。最常見氣道問題，比如後鼻孔閉鎖、喉軟骨發育不良或氣道囊腫導致吸氣功能障礙，這部分孩子一定要處理好，把氣道開放，打開氣道，就可以解決呼吸衰竭；第二個是肺部的疾病，新生兒期的肺部疾病，包括早期的呼吸窘迫綜合徵，主要表現為進行性加重的呼吸困難，這種孩子需要增氧；還有一些新生兒，出現胎糞吸入，胎糞吸入也是一個很重要的病因；對於晚期早產兒，還可能出現感染性肺炎，比如呼吸道合胞病毒或者腺病毒，還有流感病毒這些等感染引起肺部炎症，在嚴重的時候會引起新生兒呼吸衰竭；特別是有些早產兒，本身肺發育不完全，很容易併發支氣管肺發育不良，當併發感染的時候很容易出現呼吸功能不全，出現新生兒敗血症。