先天性心臟病手術後一般很少復發。先天性心臟病為心血管系統在先天發育過程當中產生的結構畸形，因此很難界定其復發的範疇，但先天性心臟病在功能上可能復發，主要如下：

1、房間隔缺損或室間隔缺損的患者，通過手術修補後，會因為各種原因導致病變處出現漏洞，如縫線鬆弛、手術時因視野原因，導致缺損沒有修補完全，漏出較多的患者，如在術後早期發現，可再次進行手術將缺損修補完善，但如果沒有及時發現，患者出院之後出現殘餘瘻，則可認為該疾病在功能上覆發，此時可能需要二次手術；

2、瓣膜畸形的瓣膜整形手術效果較好，可以達到預期效果，但一段時間以後，瓣膜功能會出現下降，從而導致瓣膜反流，此類情況也可理解為復發；

3、部分姑息性手術，如BT分流等姑息性手術，術後患者常因各種功能方面的原因導致症狀再次出現，即復發。

綜上，先天性心臟病患者手術以後復發概率較小。