直腸炎本身屬於難治性疾病，如慢性非特異性潰瘍性直腸炎，病變可能還會向上蔓延，並不侷限於直腸，可能還會累及結腸，因此在一年內難以治癒。所以需要儘量使病變維持在直腸，如果不發展到結腸則不會對人體健康有太大的威脅，比如僅存在腹瀉症狀。

治療上需進行藥物治療或穴位的強化埋線，強化埋線與穴位埋線不同，該方法應用可吸收線。但是羊腸線吸收較慢，目的是給予穴位強化的持續刺激。而且埋在人體的穴位裡面，這樣對於直腸炎的治療效果目前比較理想。