導致先天性心臟病原因較多，主要有以下幾點：

1、雙親患有先心病，第二代患先心病危險性則為10%左右；

2、孕婦患有糖尿病未經治療和控制者，可導致胎兒先天性心臟病危險性增加2%，如果妊娠早期病情控制穩定，則危險性有所下降；

3、孕婦在妊娠早期接觸致畸藥物，如含鋰、苯妥英鈉或類固醇等都可導致胎兒先心病患病率升高2%左右；

4、妊娠早期如果受到放射性物質，如X射線、同位素等過量照射，可以增加發病率；

5、病毒感染，婦女在懷孕最初3個月，特別是孕3-8周遭到病毒感染，胎兒易發生心血管畸形。其中風疹病毒是引起胎兒先心病的主要原因，此外，流感、流行性腮腺炎、柯薩奇病毒、皰疹病毒等也可能導致小兒先天性心臟病；

6、近親婚配，屬於使胎兒致畸、發生先心病的高危因素；

7、不良嗜好，孕婦或丈夫吸菸，妻子被動吸菸，均可使胎兒畸形發病率有所提高。夫妻酒後同房受孕會使胎兒染色體發生異常，生下患酒精中毒症嬰兒，此類嬰兒大多數伴有心血管結構畸形。