少數子宮內膜異位症患者到一定年齡會自己好。子宮內膜長在宮腔裡，如經血倒流或者其他原因導致子宮內膜進入子宮外，如種植在卵巢或者子宮直腸窩等處，子宮內膜剝脫時出現子宮出血，同時在異位處也會出現出血，此類出血可通過陰道排出體外，但是在腹腔子宮外的出血點無法排出體外，時間久以後異位病灶越來越大，可能出現嚴重症狀，如下腹痛、痛經，甚至會壓迫直腸導致腸穿孔等，但腸穿孔相對少見。

多數子宮內膜異位症患者沒有任何症狀，也沒有疼痛，超聲檢查沒有囊腫進行性增大，可以不進行治療。如果患者出現較小的囊性病變，可以通過藥物治療，嚴重者需要手術治療。接近絕經期的婦女，卵巢子宮內膜異位結節並沒有增大，也沒有明顯症狀和不適，到卵巢功能消退時此結節也會消退。