子宮內膜異位可以進行B超檢查。臨床上常用B超檢測子宮內膜異位症，子宮內膜異位症為宮腔內子宮內膜異位到其它位置，最常見位置為卵巢和盆腔，侵及卵巢時形成經典卵巢巧克力囊腫，B超顯示為密集光點狀回聲，卵巢囊性包塊可為5cm、3cm左右，早期可能為1-2cm，B超可以清晰顯示。

子宮內膜異位到肌層之間時，患者會出現漸進性加重的痛經，臨床表現不同，但B超下顯示子宮肌壁間低迴聲區，無邊界，提示子宮腺肌病。所以B超可以幫助診斷子宮內膜異位症。