子宮內膜異位症通常而言，其表現是多種多樣的，一般都和月經週期是密切相關的。最常見的一些臨床表現如下：

1、下腹的疼痛及痛經：一般出現在月經來潮開始，有時可能持續整個月經週期，直至月經乾淨為止。疼痛的部位一般也都位於下腹部、盆腔、腰骶部，有時放射至其他部位，典型的表現通常即為繼發性、進行性的加重。有時疼痛的程度與病灶大小並不成比例，當有些人痛經比較明顯時，實際上病灶並不一定非常大，而且有20%-40%的患者並無痛經的表現；

2、性交時的深部疼痛：尤其在月經來潮前表現的更為明顯；

3、患者合併不孕：其原因可能是盆腔內環境的改變，以及一些異常的免疫因子的表達；

4、伴有盆腔包塊：甚至盆腔包塊的結節。