直腸炎吃藥，一般多數都應用中藥，中藥可以採用辨證論治的方法。中藥常用的包括固本益腸片、香連片，對慢性直腸炎都可以應用。

急性直腸炎需要應用葛根芩連丸，有些小粒葛根芩連微丸在臨床上都比較常用，這是口服方面。直腸炎更多都是採用栓劑和灌腸藥物，灌腸藥物也有成藥，比如康復新液或者複方黃柏液都可以用，在臨床上應用也比較廣泛，用做保留灌腸對直腸炎有比較好的療效。

還有栓劑，比如美沙拉秦栓或者美沙拉秦灌腸液，都是可以應用，對直腸炎效果都非常不錯。