兒童白血病的發病原因類似於其它癌症，發病原因尚未明確。雖然目前隨著基因檢測、二代測序技術發展，發現有很多腫瘤易感基因，比如TP53基因突變，既可能患白血病，也可能是肺癌，也可能是其它腫瘤。所以，類似的腫瘤易感基因與發病有關，此類家族腫瘤患者相對多，但只是其中一個原因。

目前並不認為白血病是遺傳性疾病，而外界因素，包括射線、化學汙染，還有感染，尤其是EB病毒感染、存在免疫缺陷，可能更容易導致患有腫瘤性疾病。除了汙染之外，各種壓力也會造成患兒免疫力低下，導致容易患腫瘤，包括白血病。

所以，兒童白血病的病因並不清楚，現在還是在不斷進行研究，其由綜合因素導致，而不是單一因素所致。