直腸炎常採用美沙拉秦栓劑治療，即從肛門直接塞藥進行治療，亦稱納肛，一般每天兩次，即上午一次、下午一次，治療效果較佳。同時患者也可口服美沙拉秦片劑進行治療，但口服藥進入直腸後，其治療成分大部分均已被吸收，濃度較小，療效不如將藥從肛門塞進或直接灌入，利於藥物直接作用於直腸局部，目前直腸治療多采用此方式。