法洛四聯症病因與其它先心病一樣，均未完全明確。可與遺傳、環境等多因素相關。最主要原因為胚胎發育期，心臟漏斗部向前、向左移位，導致心臟的四個畸形，稱之為四聯症，四個畸形包括肺動脈瓣狹窄、高位室間隔缺損、右室肥厚、主動脈騎跨，統稱為法洛氏四聯症。患者首選心臟外科或心血管外科就診，隨臨床技術發展，建議儘早安排手術，無症狀者可在2週歲左右手術，有症狀或較重症狀者可在1歲左右安排手術，缺氧發作出現心跳驟停者應進行急診手術。