足底的蹠疣體積較大，較難去除，可以多次冷凍治療，也可以嘗試使用平陽黴素或者干擾素皮損根部注射治療的方法，平陽黴素一般是10mg，用1%的普魯卡因20ml稀釋後在疣體根部注射，每次注射0.2-0.5ml，每週注射一次。而干擾素一般是使用200-300萬單位加註射用水2ml，皮損根部注射，隔日注射一次。

對於上述方法仍不能去除者，還可以嘗試給予干擾素每次100-300萬單位皮下或者肌內注射，隔日一次或者每週3次，一般療程需要4-6周，可以同時配合口服阿維A或者異維A酸。