對抽動症患兒給予視頻腦電圖檢查，對臨床診斷存在重要價值。因為抽動症診斷本身無特異性客觀指標，臨床表現與多種疾病症狀相似，並且同時可以出現共存，例如癲癇發作，導致臨床存在較多誤診。因為視頻腦電圖是電生理和症狀同步檢查，屬於無創性檢查，既可長時間檢測腦電功能情況，又可同步觀察患兒臨床表現，為臨床醫生充分認識抽動症症狀提供可靠依據。但有時局灶性肌肉抽搐，患兒僅單純性表現為眨眼、搖頭、聳肩、肢體抖動，仍然應該與癲癇肌陣攣發作和小兒腦病，例如腦炎、舞蹈症、中毒等相互鑑別，這是視頻腦電圖在鑑別診斷方面起關鍵性作用。

此外，症狀發作可以與腦電圖同步電生理相對照。如果在症狀發生前、中、後期，腦電圖表現正常，同時排除腦病的其它症狀，則可以診斷為兒童抽動症。抽動症患兒的腦電圖表現為非特異性，部分可以出現脈搏增多，調節調幅差，反映患兒可能存在輕微腦神經損害和行為異常障礙，同時部分患兒在腦CT、核磁不能診斷的基礎上，腦電圖能夠反映腦功能、大腦皮層發育情況，以綜合評價抽動障礙患者的預後。