小孩發燒驚厥後是否存在後遺症，主要根據發燒驚厥的原因而定。多數發燒驚厥，是發熱時由於神經系統發育不完善所致，稱為熱性驚厥，發作後不產生後遺症。出現發燒驚厥時，要注意是否出現分泌物的誤吸，誤吸可引起肺部感染或者在抽搐過程中對牙齒或者口腔黏膜造成損傷，可快速緩解，多數情況下不造成後遺症。

部分的發熱驚厥屬於複雜性熱性驚厥，和普通的熱性驚厥有差異性。隨著反覆發作，發展成無熱驚厥，即癲癇，是較嚴重的後遺症。另外，部分的發熱驚厥並非單純的熱性驚厥，而是因為中樞神經系統的感染，如腦炎、腦膜炎、結核型腦炎，在治療不當的情況下，可出現後期智力損傷或者肢體運動損傷等後遺症。