腦炎頭疼部位廣泛。常可伴有其它症狀，如發熱、嘔吐等，且無法描述頭痛具體位置，常感覺整個頭部疼痛，可引起眼睛脹疼、嘔吐、噁心表現。若頭疼部位侷限，且可明確位置，多數考慮並非腦炎引起疼痛，可為鼻竇炎或中耳炎導致疼痛。

因此家長朋友務必關注，若孩子是反覆頭痛且伴隨有發熱、嘔吐、精神狀況不好、嗜睡表現時，高度考慮腦炎，需儘早就醫。若僅有某個侷限位置頭痛，且能夠緩解，不痛時精神狀況良好，則不一定為腦炎，可為其它疾病引起頭痛。若不能分辨需到專科醫生處就診，明確頭疼性質。