狹顱症手術應宜早不宜遲，對於早期發現的狹顱症，尤其單條顱縫閉合這種情況，採取微創手術，通常在4個月之內進行，2個月之內效果更好。但4個月之內進行微創手術，患者會再次閉合，即患者有發生二次變形的幾率。

除微創手術以外，其它類型的手術均主張在6-12個月內進行手術，此為黃金時段。這時手術既不影響患者大腦發育，也能降低手術風險，減少手術併發症。

在1-2歲之間，手術也可以進行，其也為較好的時機，但比6-12個月差些。此時手術可糾正頭部外形，擴大顱腔，但大腦生長速度已經開始變慢，因此得到的益處顯然會小於6-12個月時手術。對於2歲以上的寶寶，仍然有機會選擇手術矯形。