懷孕如果合併細菌性陰道炎，需要找專業醫生檢查判斷為支原體、衣原體還是厭氧菌感染。孕期因為激素水平改變，陰道自淨作用較差，易得細菌性陰道炎。其中厭氧菌感染較多見，可外用藥物治療，治療需根據感染菌不同使用不同藥物。

細菌性陰道炎用藥治療需經醫生處理，不可自己反覆用藥物沖洗陰道，有時會破壞陰道內環境，酸鹼失衡後陰道炎會加重。