性早熟打針治療相對比較安全，但並非完全無副作用，一般有以下幾種副作用：

1、局部一過性疼痛、潮紅、皮疹，短時間內會自動消失，不需要特別處理；

2、部分患者可能有過敏反應，但幾率較小；

3、點火效應：有些孩子打完針後1-2周可能會有些許陰道出血，因暫時性促進性腺激素分泌可能導致性發育進程稍微加快；

4、目前部分數據認為，早熟的孩子到成年期時，不孕不育率可能高於正常兒童，但只要經過GnRH-a治療，成年後不孕不育率可迴歸正常；

5、可能對骨密度有影響，但只要給予補充維生素D，一般影響不大。