性早熟激發試驗本身無危害，主要有以下幾個方面的輕微影響：

1、反覆抽血增加孩子痛苦；

2、因檢查要反覆抽血，小孩可能要經常去醫院，從而影響學業；

3、早熟激發試驗需先打GnRH-a，而GnRH-a有點火效應，可能導致短暫性促進性腺激素分泌。

雖然性早熟激發試驗有上述輕微危害，但如果小孩已經發育啟動，而且是早熟，如中樞性性早熟，則有必要做性早熟激發試驗。但如果目前兒童本身處於發育時期，但第二性徵、線性生長加速、骨齡以及性腺增大均不明顯，可暫時不做性早熟激發試驗。