大部分小兒類風溼不能自愈，小兒類風溼疾病治療療程非常長，需用多種藥物不停調整，不停更換方案，因此小兒類風溼的治療並非像想象的那麼簡單，而整個治療過程，需重新評估易治療還是難治性，制定方案後觀察幾個月，然後再進行關節炎評分，大部分未看到自愈傾向。治療隨病情變化而變化，病情輕的患者，用輕的方案，病情重的患者，用重的方法。

小兒類風溼是無法除根的疾病，需長久治療。但僅有較輕時才逐漸減藥，逐漸減藥到維持較小劑量，很少有一段時間甚至數年可停藥觀察，但如再發作時還需再應用藥物。