對大部分女性而言，發生一次自然流產後，第二次懷孕的風險較小，研究顯示發生一次自然流產後，即便不進行任何干預治療，大部分女性第二次懷孕也是可以正常分娩。對於不存在導致自然流產高風險因素的女性，包括體重過輕或過重、高血壓、糖尿病、吸菸、酗酒，發生一次自然流產後，可以積極進行第二次備孕。如果第二次懷孕仍然發生自然流產或胚胎停育，此時應進行系統檢查。

女性首先應對流產的胚胎組織進行染色體檢測，對於大部分的自然流產而言，胚胎染色體異常所佔的比例較高，其次當胚胎染色體檢測未發現異常時，再進行其他導致流產高風險因素的排查，如是否存在子宮解剖結構異常、子宮肌瘤、子宮腺肌病、縱隔子宮，也可以導致自然流產的風險增加，其他的包括免疫系統紊亂、抗磷脂綜合徵、結締組織病，以及是否存在內分泌紊亂。因此如果想明確自然流產原因，應進行系統、全面排查，再進行針對性干預治療，降低再次妊娠發生自然流產的風險。