根據手足口病近些年來的流行趨勢，目前認為手足口病流行間隔期一般為2-3年。一旦被傳染上手足口病，少數患者尤其是＜3歲者病情進展迅速，在發病1-5天出現腦膜炎、腦炎、腦幹炎、腦脊髓膜炎、肺水腫、循環障礙等；極少數患者病情危重可以引起死亡，存活病例可留有後遺症。

手足口病是由多種腸道病毒感染導致的急性傳染病，其中以柯薩奇A16型和腸道病毒71型最為常見。1957年新西蘭首次報道該病，20世紀70年代中期，保加利亞、匈牙利相繼爆發EV71所致的手足口病流行。保加利亞報告病例750例，其中有149人致癱，44人死亡。20世紀90年代後期EV71開始在東亞地區流行，1997年馬來西亞發生了主要由EV71引起的手足口病流行，4-8個月共有2628人發病，僅4-6個月就有29例患者死亡。這些死亡患者當中，平均年齡僅僅只有1.5歲，病程僅2天就可以迅速出現死亡。2008年全國31個省市共報告手足口病例48萬8955例，其中重症患者1165例，死亡126例，報告發病率為37/100000，病死率為0.03%。