手足口病輕微發熱的患兒可自限，部分患兒發熱比較嚴重，治療原則為低於38.5℃的患兒應多飲水、多休息，超過38.5℃的患兒需要給予退熱藥物處理。如果超過39℃，必須立即處理高熱，因為高熱可以誘發驚厥、抽搐，部分高熱病人還可能會出現腦炎，要及時處理。

一般常規使用的退燒藥是布洛芬或者對乙酰氨基酚，通常布洛芬對胃的刺激性比較大，如果體溫正常，不給予布洛芬。如果對胃刺激比較大，兒童無法服用或者是服用以後出現噁心、嘔吐症狀，也可以選擇對乙酰氨基酚，該藥比較溫和。如果高熱持續不退，還可以給予溫水擦浴以及冰塊冷敷額頭等，最重要的還是要及時就醫，到醫院進行正規處理。