妊娠合併心臟病可以引起孕婦肺動脈高壓、缺氧和發紺、心律失常、心臟擴大、心力衰竭、肺水腫、細菌性心內膜炎、靜脈栓塞和肺栓塞、心源性休克、猝死等。也會影響胎兒，會發生流產、早產、死胎、胎兒生長受限、胎兒窘迫、新生兒窒息等併發症，治療心臟病的某些藥物也可能對胎兒存在潛在毒性。

大多數先天性心臟病為多基因遺傳，如果雙親中任何一方患有先心病，其後代發生先天性心臟病及其它畸形的概率增加五倍，比如室間隔缺損、肥厚型心肌病、馬凡綜合徵等，均有較高遺傳性。所以對於合併先心病的孕婦，在胎兒的檢查中也要多次做B超，去排查上述心臟結構異常。