治療小兒慢性結腸炎的方法包括：

1、感染性結腸炎：可用抗菌素治療，小兒用抗生素包括頭孢、黃連素、甲硝唑等；

2、抗生素相關性結腸炎：可停掉以前用的抗生素，再採用益生菌治療；

3、過敏性結腸炎：需停掉過敏食物再逐步恢復；

4、潰瘍性結腸炎：需根據病情選擇使用美沙拉嗪等柳氮磺吡啶藥物，較重可採用激素，還可進行其它輔助治療；

5、飲食調整，不吃油膩的食物，多吃易消化、易吸收的食物，且宜少吃多餐。