所謂的慢性結腸炎，可能有的人症狀比較輕微，只表現為大便次數增加，每天大便3-4次或者可能有5-6次，大便含水量多。
個別人可能會有腹痛，但腹痛一般都不會特別劇烈，以隱痛為主。或者有脹痛，有的人會有腹脹、裡急後重等。裡急後重指病人老想去衛生間，去了之後又排不了多少，排一點，排完之後覺得還有便意，老覺得有大便排不乾淨。主要原因是直腸下段充血水腫，刺激局部感受器以後，病人老覺得有大便，實際上並不一定有大便，所以出現裡急後重的症狀。
除了腸道症狀以外，可能還會出現全身症狀，見於比較重的腸炎，可能有發熱，發熱根據情況有的可能是低熱，高熱不是很常見，有時也可以出現高熱。另外出現營養障礙，出現消瘦、乏力、低蛋白血癥等，嚴重的可能有貧血。
腸外的表現，這個病出現關節表現，雖然腸炎表現關節疼痛，或者皮膚上出現結節紅斑，還有皮膚上小的癤腫等。眼睛的病變包括虹膜炎、睫狀體炎都可以是腸炎腸外的表現。待腸道炎症狀好了之後，腸外的表現即可消失。