慢性萎縮性胃炎的臨床表現不僅缺乏特異性，而且與病變程度並不完全一致。臨床上，有些慢性萎縮性胃炎患者可無明顯症狀，但大多數患者可有上腹部燒痛、脹痛、鈍痛或脹滿，尤以進食後明顯，食慾不振、噁心、噯氣、便秘或腹瀉等症狀。嚴重者可有消瘦、貧血，少數胃黏膜糜爛者可伴有上消化道出血。其中A型萎縮性胃炎併發惡性貧血在我國少見。本病無特異體徵，上腹部可有輕度壓痛。慢性萎縮性胃炎內鏡下也可出現，如胃黏膜顏色變淡，黏膜皺襞細小甚至消失。