陰莖痛是患者就診的重要主訴，需具體分析原因，具體如下：

1、陰莖本身有疾患：包括有無陰莖硬結症、陰莖炎症、陰莖皮膚疾患如陰莖皮膚黴菌感染，可以造成陰莖局部損害；

2、創傷：可造成陰莖疼痛，臨床上可見由於粗暴性交造成陰莖海綿體折斷，但較少見；

3、慢性前列腺炎：疼痛點在前列腺、會陰深處，但是多投射到其它部位，常見部位為恥骨區、小腹、陰莖、睪丸、大腿內側等，其中陰莖根部和陰莖是經常投射區域，陰莖疼痛時需要做出鑑別。